Zagadnienia Filozoficzne w Nauce to czasopismo wydawane pod auspicjami Centrum Kopernika Badań Interdyscyplinarnych i Ośrodka Badań Interdyscyplinarnych w Krakowie. Specyfika tego pisma, w porównaniu z innymi zajmującymi się podobną tematyką, polega na tropieniu i analizowaniu problemów filozoficznych uwikłanych w nauki przyrodnicze. Takie teorie naukowe, jak ogólna teoria względności, mechanika kwantowa, teoria ewolucji czy koncepcje powstałe na gruncie nauk kognitywnych prowadzą do pytań o wyraźnym wydźwięku filozoficznym. Dla zrozumienia, czym jest nauka i skąd bierze się jej sukces, a także jakie są jej powiązania z filozofią, doniosłe znaczenie mają też publikowane na łamach Zagadnień prace z historii i metodologii nauk. Pismo, obok artykułów naukowych, zawiera też duży dział recenzji. W Zagadnieniach publikują nie tylko krakowscy uczeni, ale także autorzy z innych, także zagranicznych ośrodków naukowych.

Najnowszy, 52. numer Zagadnień Filozoficznych w Nauce, publikowany jest po raz pierwszy przez Copernicus Center Press. Obok wydawcy, zmianie uległa także szata graficzna pisma. Będzie też ono odtąd ukazywać się co kwartał, a nie, jak dotąd, jako półrocznik. Co roku jeden numer Zagadnień będzie miał charakter monograficzny.